方法
病例定义使用以下三种方法中的至少一种在呼吸道标本中检测出-nCoV阳性：分离出-nCoV，或者实时逆转录聚合酶链反应（RT-PCR）至少有两次显示-nCoV阳性，或者检测出与-nCoV匹配的基因序列（通过三种方法之一从患者的支气管肺泡灌洗液样本中鉴定出基因组：Sanger测序，Illumina测序或纳米孔测序）。统计学分析通过分析12月10日至1月4日期间发病病例的数据来估算疫情的增长速度，预计在12月13日武汉疫情正式宣布之后，发现的感染比例将很快增加。带有人畜共患病感染的模型（通过使用更新方程式来计算）来确定与华南海产品批发市场没有联系的发病日期，并且使用此模型来得出流行病的增长率，流行病的倍增时间和基本繁殖数（R0），指在未感染人群中，一个病例在其传染期内平均会产生的额外病例的预期数量。该研究基于SARS的序列间隔使用了信息性的先验分布作为序列间隔，平均值为8.4，标准偏差为3.8。使用MATLAB软件（MathWorks）进行潜伏期，连续间隔，生长速率和R0的分析。使用SAS软件（SASInstitute）和R软件（RFoundationforStatisticsComputing）进行了其他分析。结果
在最早的例NCIP确诊患者中，中位年龄为59岁，56%为男性（表1）。表1截至年1月22日时武汉新型冠状病*感染肺炎患者的特征。*分母减小表示有缺失数据。因为舍入，百分比总计可能不是在年1月1日前发病的病例中，大部分（55%）与华南海鲜批发市场相关，而在此后发病的病例中，仅8.6%与华南海鲜批发市场相关（图1）。图1.中国武汉最早的个新型冠状病*（-nCoV）感染肺炎（NCIP）确诊病例的发病情况。平均潜伏期为5.2天（95%置信区间[CI]，4.1~7.0），潜伏期分布情况的第95百分位数为12.5天。在初期，倍增时间为7.4天。由一人传至另一人的平均间隔时间（serialinterval）为7.5天（95%CI，5.3~19），基本再生数估计为2.2（95%CI，1.4~3.9）（图2）。图2.事件发生的关键时间的分布情况。潜伏期的估计分布情况见图A。由一人传至另一人的间隔时间的估计分布情况见图B。从发病至首次就诊的间隔时间的估计分布情况见图C。从发病至住院的间隔时间的估计分布情况见图D结论：根据这一信息，有证据表明，自年12月中旬以来，密切接触者之间已发生人际传播。如果其他地区的传播动力学也相似，我们将需要付出相当大的努力来减少传播，从而控制疫情。应在高危人群中采取预防或减少传播的措施（由中国科学技术部等资助）。讨论
该研究对NCIP传播动力学和流行病学特征所做的初步评估。尽管最早的病例大多数与华南海鲜批发市场相关，且患者的感染原因可能是发生人畜共患病或环境暴露，但如今显然已发生人际传播，而且疫情在最近几周逐渐加剧。该研究也为下一步分析提供了重要参数，包括评估疾病控制措施的效果和预测感染未来的传播情况。该研究存在对新型病原体感染，尤其是在早期阶段进行初步研究时都面临的局限性，此时对疫情的各个方面都知之甚少，而且缺乏诊断试剂。为了提高早期检测和诊断的灵敏度，研究人员在识别病例时考虑了流行病学史，并随着信息的增多不断做出修订。武汉于1月11日获得PCR诊断试剂之后，病例的识别变得容易，这个有助于缩短病例确诊所需时间。此外，病例检测中最初