感谢所有专家秉持专业和公正的态度参与本年度十大进展的推荐和评选,感谢我所NGDC冯昶瑞同学在本次活动资料整理和图片设计工作中所付出的努力!
祝贺所有入选工作的团队!GPB也祝愿大家在新的一年里身体健康、工作取得更多进展!
GPB
年3月8日
环形RNA精准定量和可变剪接体转换识别算法—CIRIquant
环形RNA是一类在真核生物中广泛存在的具有特殊环状结构的非编码RNA分子。能否从海量的测序数据中高效识别、组装和注释环形RNA及其不同形式的转录本,成为后续功能验证及表达调控机制研究的重要前提。中国科学院北京生命科学研究院赵方庆团队通过重构具有反向剪接特征的环形RNA参考序列,简化复杂的反向剪接位点比对问题,并结合测序读段比对到参考基因组和环形序列的结果,筛选出了高置信度的来自环形RNA的读段,解决了目前环形RNA识别和定量方法中准确度低和假阳性率高的问题。团队发现了两类环形RNA剪接体转换事件:线性/环形比例转换和成环位点使用偏好转换。该研究实现了对环形RNA及其母本基因的精确定量,为后续挖掘和筛选具有潜在功能的环形RNA提供了重要工具。
该成果发表于NatureCommunications
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